> Je pakt een beker op in zwaartekracht, maar duwt hem naar beneden zonder  zwaartekracht

Als er geen zwaartekracht is, dan zal duwen de beker een kinetische energie krijgen die afkomstig is van de arbeid die jij erop verricht. Zeer waarschijnlijk zul je, vanwege impulsbehoud, zelf naar achteren bewegen (en kun je dus niet de beker blijven duwen). 

Als er zwaartekracht is, dan is er potentiele energie (a.g.v. de positie in het zwaartekrachtsveld). Als er geen zwaartekrachtsveld (of ander krachtveld) is dan is er geen potentiele energie en verandert die ook niet door te duwen. Dan is er energiebehoud omdat jij arbeid levert en de beker arbeid ontvangt. Netto verandert de energie van jou + beker dus niet, slechts een overdracht.

>scenario 1 waar de de beker zijn energie kon omzette in warmte en geluid?

Door vallen neemt de kinetische energie van de beker toe, de potentiele energie af. Als dit in de lucht gebeurt zal door het wegduwen van luchtdeeltjes wellicht wat geluid en wrijving ontstaan - ook die komt van de potentiele energie vanwege energiebehoud:  potentiele energie (voor) = (na) kinetische energie + warmte + geluid.

Als de beker op de grond valt zal hij uiteindelijk daar blijven liggen en is alle potentiele energie omgezet in warmte, geluid en vervorming (van de beker en vloer).